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创造一个公平的实现网络学术出版商

计算机与视觉

2021年1月29日|卡梅尔麦克纳马拉,IOS出版社,阿姆斯特丹,问
使数据可发现的指导原则的实现,可访问、可互操作、可重用(公平)依赖于公众的支持与合作。研究人员和更广泛的数据通过实现网络社区是推进开放的科学文化,这是核心的车辆司机去公平的倡议,推进全球讨论数据管理。在本月发表的一篇文章信息服务和使用Jan Velterop和埃里克·舒尔特呼吁组建这样一个新的网络学术出版商。在这里,我们提供摘录文章,介绍了宣言和目标提出了新的网络。

通过卡梅尔麦克纳马拉,IOS出版社,阿姆斯特丹,问

使数据可发现的指导原则的实现,可访问、可互操作、可重用(公平)依赖于公众的支持与合作。研究人员和更广泛的数据通过实现网络社区是推进开放的科学文化,这是核心的车辆司机去公平的倡议,推进全球讨论数据管理。在本月发表的一篇文章信息服务和使用Jan Velterop和埃里克·舒尔特呼吁组建这样一个新的网络学术出版商。在这里,我们提供摘录文章,介绍了宣言和目标提出了新的网络。

IOS媒体有责任确保内容发表在期刊和书籍可以和发现。我们通过确保机器可读内容和元数据是公开的(通过关联数据门户),符合公平原则,首次谈及在早些时候的一篇博客文章(见本网站在这里)。

这是观看的兴趣文章从近年来出版信息服务和使用(ISU)侧重于公平的运动。在2017篇文章中,Barend蒙斯等人重新审视公平的指导原则澄清一些解释的支持取得了进展[1]。从那时起,去公平组(即。实现网络)如雨后春笋般在不同的习惯和最佳实践基于特定的学科。新ISU文章发表在2021年1月,现在要求学术出版商参与制定协议和标准,使机器可读的(因此公平)研究材料,并概述了一个方法,这将有助于实现公平原则以一致的方式[2]。这篇文章已经是受欢迎和通过IOS,成为ISU纸媒体本月内容平台。阅读摘录如下。

文章标题:学术出版商的公平实现网络(APIN)(发表在《信息服务与使用)

学术出版商去公平实现网络(APIN)

Jan Velterop和埃里克·肖特
信息服务和使用,40卷,空间站。4,333 - 341页

沟通的科学研究成果是科学进步的支柱之一。传统上,发表(叙事)文学的主要材料是构建这个支柱。以前发表文章的数据补充,但在过去的几十年这个关系经历了一个反转,这些文章越来越成为核心研究成果,补充数据,当他们描述后者的解释,起源和意义。在这种倒置,我们可能会开始把“数据出版”,与“补充文章”。一篇文章应该属于“来源丰富的元数据的集合(虽然本身不是机器可读的,但使人来确定实际的“可重用性”和“适用性”。

此外,数据存储库发挥着越来越重要的作用在科学交流和发现过程,数据可用性和可重用性成为一个至关重要的元素在科学的效率和有效性。旧的方法,它依赖于“数据要求”(甚至在“所有数据可从相应的作者合理请求”)不再适用,即使,或者说,如果数据容易获得和使用。越来越多的科学也依赖于数据集,要么是太大而复杂的被请求,提供合理与否,从作者的交流的方法。

在许多学科,如医疗和心理科学,数据经常过于隐私古典意义上的“共享”。他们需要匿名,即便如此,信任水平的必要保证隐私总是不能实现。一个解决方案是,数据没有共享通过使它们可用在传统的方式,而是通过从而能够分析数据的“访问”他们privacy-secure筒仓。个人健康的火车就是一个很好的例子:这里的关键概念是把算法他们发生的数据,而不是将所有数据中心位置。算法只是“访问”数据,,这意味着没有数据需要复制或下载到另一个位置。个人健康训练旨在给控制访问异构数据源,同时确保个人隐私保护和最大接触病人,公民和其他实体保护数据隐私的强烈兴趣。数据训练是一个通用的概念,显然,它也可以应用健康科学以外的地区。概念,数据需要公平。公平在这个背景下有一个独特的和精确的含义。它代表可发现的数据和服务,访问,可互操作和可重用的机器。

元数据
在新的模型支持公平数据出版物,元数据是关键。出版商和预印本平台的最重要的角色是确保详细的、特定于域的,和machine-actionable元数据提供所有出版物,包括文本、数据、表格材料,和图片。换句话说,所有的研究对象的发布。这些元数据需要符合相关的标准所涉及的领域和学科。他们需要正确应用利用创建的受控词汇表或与实践领域专家密切磋商。一些所需的元数据组件已经(几乎)普遍使用,例如数字对象标识符(必须),虽然不是在所有情况下,让他们用于机器阅读。经常,DOI链接到登录页面或抽象,设计为被人类,人类的眼睛和手指是依靠执行最后的链接到对象本身,如PDF。显然,这种方法是不令人满意的机器更多的数据和信息的分析。

给定文本的信息和数据密度的文章,是有意义的断言转换成语义丰富,machine-actionable对象,根据资源描述框架(RDF),一个家庭的World Wide Web Consortium (W3C)规范。在可能的情况下,主张利用特定于域的词汇表和RDF标记可以作为语义三元组及其适当的元数据(“nanopublications”)。如果一切顺利,在一篇文章中提到的断言和索赔的抽象应该抓住文章的要点(至少作者的满意度),而且表格数据可以以这种方式对待。上面的结果应该是一个公平的数字对象(FDO),一个数字的“双胞胎”最初提交的研究对象。不建议做这一切的责任应该只在出版商的肩膀上,而是应该合作的出版商和(准)作者和越来越多的数据管家。

出版商将提供一些适当的工具,并在必要时火车(或限制),作者指出重要的断言,声称他们的文章。有用的RDF元数据工具的例子使公平出版容易(或者至少更容易)可扩展数据中心的注释和检索(雪松)和BioPortal库有800多个受控词汇表,很多来自特殊的领域。越来越雪松被部署为所谓的元数据的主要工具机器车间,在公平的元数据专家与领域专家一起工作来创建适当的公平的元数据的文物。

对于学术出版商来说,这一切都意味着什么呢?
提出的大部分应该可以纳入当前流程和工作流。出版商已经添加元数据发布。延长此元数据,并增加其粒度不太可能大多数出版商的根本变化。这本身就说明了这一点,作者需要参与确定什么是“重要的断言”文本的文章,和任何术语的意义是什么。如果作者使用NLP这个术语,例如,它不应该被出版商决定如果这意味着“神经语言程序学”或“自然语言处理。“有各种技术将使简单而高效的实现工具,作者添加语义明确断言他们的手稿,在他们目前的方式添加关键字(尽管那些经常是相当模糊的意义,必须避免关键断言)。

发布过程不应该与目前使用的一个,如下图1所示。最主要的是创建(安排)的创建一个公平的“双胞胎”的原始研究对象提交。

图1:研究对象的流动通过发布过程(来源:ISU的文章;信贷:Jan Velterop和埃里克·舒尔特)

图1:研究对象的流动通过发布过程(来源:ISU的文章;信贷:Jan Velterop和埃里克·舒尔特)

提出宣言
学术出版商实施网络(APIN)被认为是一个公平的实现网络,需要一个“宣言”。这样的宣言是为了表达关键问题的通用的重视公平的目标,和APIN的合作伙伴达成了共识。宣言提出如下(见附表1),和在这个阶段受到协议,修改,和接受初始APIN伙伴。

APIN设想是由学术出版任何条纹的服装,无论是商业,社会出版商,或预印本平台。它的主要目的是开发和促进最佳实践“机器”发布符合公平原则。这些最佳实践将适用于传统学术交流,但通过适当的机器可读的再现和组件。

所有APIN参与者承诺遵守交战规则的公平实现网络“交战规则”,致力于公平原则和接受为正式供应商锁定或零容忍。

最初的主要任务
接下来的主要任务是配合的伙伴APIN详细计划的执行和进一步发展路线图的过程就成为一个公平的实现网络已经开始。也为作者开发规则刺激适当的公平数据发布与公平的数据点在信任存储库,支持最大机可寻性,可访问性和互操作性的重用。

箱1:提出APIN宣言

每个APIN合作伙伴:

  • 数据符合公平原则:遵守治理原则:APIN伙伴将正式承认和认可的一般治理原则公平的倡议。
  • 接受stakeholder-governed: GO IFDS stakeholder-governed是公平的实现方法。协调、董事会掌控组织的利益相关者实现网络社区创建信任组织将决定由社区共识,考虑不同的利益。
  • 接受非歧视性的会员:愿意签署交战规则时,任何利益相关者可能表达感兴趣,应该欢迎加入公平。
  • 进行透明操作:实现信任治理团体代表的选择将是最好通过透明的一般流程和操作(在隐私法律的约束)。

有针对性的目标APIN:

  • 提供为每个故事(或元素)条machine-resolvable全球独一无二的,持久的和可分解的标识符语义文物。
  • 本文为每个主要提供相同的概念(如经典的“关键字”)的延伸。
  • 请求帮助,作者的文章指出,并尽可能的格式是机器可读的语义三元组,在原来的贡献主要的断言和主权。
  • 确定,GO-FAIR的指导,这是适当的工具为出版商提供作者的请求让他们去做他们在上面的点。
  • 要求作者补充材料,包括大型数据集,在可能的情况下以机器可读的格式,帮助作者这样做有困难,而且,在机器可读的格式提供数据集的数据证明了(还)不可能,至少提供机器可读的数据集的元数据。

以上包括简短的摘录。引用应该是原文,可以访问在这里

引用

1。Barend隆起et al .,“多云,越来越公平;回顾公平数据指导原则对欧洲开放科学云”,信息服务和使用,37卷,空间站。1,49-56,链接:content.iospress.com/articles/information-services-and-use/isu824(最后访问:2021年1月29日)。
2。Jan Velterop和埃里克·舒尔特,“学术出版商的公平实现网络(APIN)”信息服务和使用,40卷,空间站。4,333 - 341,链接:content.iospress.com/articles/information-services-and-use/isu200102(最后访问:2021年1月29日)。

文章摘要:

学术出版商去公平实现网络(APIN)

Jan Velterop和埃里克·肖特

提案提出了对学术出版行业积极参与制定的协议和标准,使出版科研材料机器可读可发现的,为了方便数据访问,互操作和可重用(公平)。鉴于传统学术期刊时沟通的重要性在世界范围内,积极参与学术出版商在推进公平的程序创建和重用数据是高度期望。

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